由於傳統中藥行日漸式微，目前有消息指出，全國唯一的中藥系、中國醫藥大學「中國藥學暨中藥資源學系」恐面臨停招的命運。為此，中國醫藥大學方面否認傳聞，表示只是調整系所，更解釋中藥系過往招生十分良好，也是最根本的科系，根本不可能裁撤。
根據媒體報導指出，面對中藥戲即將停招的傳聞，中國醫藥大學公關主任吳嵩山表示，基於國家需求與社會發展，大學每年都會進行例行性的增設、調整系所。先不論過往中藥系招生一直都十分良好，中藥系對中國醫藥大學而言，是最根本的科系，根本不可能裁撤。
吳嵩山指出，目前是正在評估該如何進行調整、整併，或是微調系名，但絕對不會停招。而相關的討論還處於系級階段，之後還要經過院級、校務會議與教育部報告等程序。而且這次的討論也不僅侷限於中醫系，是所有校內科系都在討論範圍內。
